生物科学与工程学院实验中心由生物发酵实验室，生物分离及酶工程实验室，发酵分析实验室，分子和细胞实验室，生物发酵中试基地等13个实验室及配套的灭菌室、接种室、培养室等组成，每个实验室都可满足约40个学生开展实验，大部分实验室配备了投影仪可开展相关领域知识培训。
实验中心的生物发酵中试基地是国内高校少有的发酵中试车间，其包含发酵罐中试线和多功能发酵产品提取中试线。发酵罐中试线是由2套全自动不锈钢的15L-50L-500L-1000L发酵罐组成，共8个发酵罐，可单独使用，也可组合使用；还包括压缩空气过滤系统，蒸汽发生器，冷水机等配套设备。多功能发酵产品提取中试线是由常见的分离提取单元组成，包括过滤，超滤，离子交换，脱色，浓缩，结晶，喷雾干燥等，各单元既可单独使用，也可串联使用，完成对发酵产品的提取分离。
实验中心还配备了完善的各类常规实验仪器，包括5L玻璃四联发酵罐，5L玻璃单个发酵罐，5L玻璃厌氧发酵罐，凯式定氮仪，超低温冰箱，灭菌锅，干燥箱，马弗炉，超净台，三层叠加震荡培养箱，生化培养箱，光照培养箱，双光束紫外分光光度计，紫外分光光度计，可见分光光度计，低速及高速离心机，落地式高速冷冻离心机，冷冻干燥机，超声波粉碎机，PCR仪，制冰机，凝胶成像系统，电泳仪，倒置生物荧光显微镜，体视显微镜，生物双目显微镜，高通量组织研磨器，二氧化碳培养箱等，可以进行微生物，植物，食用菌和分子细胞相关学科的实验及研究。
发酵中试生产线
多功能提取中试线
