江西农业大学生物科学与工程学院由生物技术研究开发中心和微生物教研室合并组建。1998年开始招收微生物专业本科生，1999年开始招收生物工程专业本科生，并成立生物工程系，2006年更名为生物科学与工程学院。2003年开始招收硕士研究生，2025年开始招收博士研究生。建院系以来，共培养本科、硕士毕业生近4000人，学院生源来自全国30个省(直辖市、自治区)。现有在校本科生1183人,硕士研究生254人。

学院现有教职工85人。其中，国家青年拔尖人才1人、赣鄱俊才等省部级及以上人才12人，博士生导师10人，硕士生导师46人﹔具有高级职称38人，外聘兼职教授11人;拥有博士学位68人。学院现有4000m²实验室和3000m²现代化教学实训基地，设备总资产3500多万元。拥有江西省农业微生物资源开发与利用工程实验室、农业微生物种质发掘与利用江西省重点实验室等2个省级重点实验室，南昌市发酵应用技术重点实验室、南昌市生物资源保护与利用重点实验室、南昌市动物病毒与基因工程重点实验室、南昌市食药用菌重点实验室4个市级重点实验室，以及7个校级研究机构、1个省级实验教学示范中心、1个校级实验教学示范中心等教学与科研平台。

学院现有生物工程、制药工程和生物技术3个本科专业。生物工程专业在2015年江西省高校专业综合评价中位列本专业第一，2018年入选“江西省一流优势专业”，2019年入选国家一流专业建设点，2020年省一流专业验收获评“优秀”，2022年生物工程专业在江西省第二轮专业综合评价中排名第二，获评“四星专业”;制药工程专业在2017年全省专业综合评价中位列本专业第二，2022年被评为江西省一流特色专业;生物技术专业为省级特色专业，为2019-2021年度校级重点建设专业。学院拥有生物学、生物工程两个一级学科，设有生物学一级博士点，微生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生物工程学术型硕士学位授权点，生物与医药领域工程硕士专业学位授予点。其中，生物学为江西省“十二五”重点学科与示范性硕士点、校“十三五”重点建设学科、校十四五“优势学科”，生物工程学科为校“十三五”重点学科。

学院坚持学科与专业、教学与科研紧密结合、协调发展。积极推进“本科生导师制”，构建与完善教学与科研平台的保障体系，注重师资队伍建设与学生实践能力培养。曾获江西省教学成果二等奖3项，出版专著3部，主编或副主编教材6部。近年来，学院教师主持73项国家级和96项省级科研项目﹔获江西省科技成果二等奖3项、三等奖2项，欧美同学会(中国留学人员联谊会)第二届“双创”大赛三等奖1项，江西省高校科技成果一、二、三等奖6项;授权国家发明专利62项;在SCI源刊及国内核心期刊发表论文400余篇。

学院坚持“三全育人”、“五育并举”，以学科竞赛为平台提升学生创新能力，以社会实践为载体建设校园文化品牌“微光同行”，以考研升学为抓手加强学风建设，全面提升人才培养质量。近年来，我院先后涌现江西青年五四奖章获得者、全省优秀共青团干部、江西省高校优秀心理委员、“江农之星”等一大批优秀师生；学院考研升学率连续五年逐年攀升，2024年达49.15%；学生综合素质、创新能力进一步提升，在全国“情系三农”微电影大赛、全国大学生生命科学竞赛、全国大学生英语竞赛、全国大学生创业计划大赛大学生全国品酒大赛、江西省大学生创新创业大赛、江西省生物技能大赛等各类赛事中取得优异成绩。暑期“三下乡”社会实践获评全国优秀团队、江西省优秀团队、江西省教育厅文明实践志愿服务行动优秀实践成果、先进个人、江西省红色走读优秀云游作品、实地走读二等奖。学院团学工作先后荣获学校“就业工作先进集体、五四红旗团委等荣誉称号。